शोध में रूचि
मैं गरवन इंस्टीट्यूट में एक जीनोमिक सिस्टम एनालिस्ट हूं, जिसकी पृष्ठभूमि क्लिनिकल पैथोलॉजी टेस्टिंग, एल्गोरिदम और सॉफ्टवेयर डेवलपमेंट में है। सेंटर फॉर पॉपुलेशन जीनोमिक्स के जीनोमिक टेक्नोलॉजीज ग्रुप के भीतर अग्रणी कम्प्यूटेशनल विकास, मैं नए जैव सूचनात्मक उपकरण विकसित करने के लिए अपने अद्वितीय कौशल को लागू करता हूं, साथ ही डिजाइन और नैनोपोर अनुक्रमण बुनियादी ढांचे का समर्थन करता हूं।
मेरे शोध क्षेत्रों में शामिल हैं:
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नैनोपोर सिग्नल विश्लेषण
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नैदानिक परीक्षण और विधि विकास
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लघु अग्रानुक्रम दोहराव विकार
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वायरल जीनोमिक्स (एचआईवी/सार्स-कोव-2)
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एकल-कोशिका अनुक्रमण
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प्रत्यक्ष आरएनए अनुक्रमण
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जीनोम असेंबली
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मिथाइलेशन का पता लगाना
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मशीन/डीप लर्निंग
प्रकाशन हाइलाइट्स
फर्ग्यूसन, जेएमऔर एमए स्मिथ (2019)। "स्क्विगलकिट: नैनोपोर सिग्नल डेटा में हेरफेर करने के लिए एक टूलकिट।"जैव सूचना विज्ञान 35(24): 5372-5373।
स्मिथ, एमए, टी. एर्सवास,जेएम फर्ग ्यूसन, एच. लियू, एमसी लुकास, ओ. बेगिक, एल. बोजार्स्की, के. बार्टन और ईएम नोवोआ (2020)। "नैनोपोर सीक्वेंसिंग और डीप लर्निंग का उपयोग करके देशी आरएनए की आणविक बारकोडिंग।"जीनोम रेस 30(9): 1345-1353।
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